到了1990年，随着各项研究的开展和使用者的日益增多，社会上出现了对这种功能水不同的意见，于是消费者委员会便提出对饮用碱性电解水进行更为权威系统的实验建议，以了解医疗用碱性电解水（pH9.5±0.3）的安全性和有效性。

1992年，厚生省提出在品质，安全性，有效性方面依据当时的科学水准进行再研究，成立了专门的电解制水机研究委员会。1993年，组成了以京都大学研究生院医学研究科卫生学教室糸川嘉则教授为委员长，由医学，农学，工学专家组成的第三者组织。

研究分成物性（产品品质）实验、动物安全性实验、动物有效性实验，以及临床实验四个方面。

实验严格按照日本药剂法规定的程序进行，在确认品质和安全的基础上，先后进行了沟鼠和食蟹猴的动物有效性实验，最后是公开及双盲的人群临床实验。根据系列研究结果，委员会就碱性电解水提出以下三点结论

1.证实了只要遵守现在的使用条件，碱性电解水是对健康没有损害的安全的饮用水。

2.具有迄今为止自来水所没有的改善某种症状的准药理效果以及增进健康的准营养素效果，判定其有用（有价值）。

3.根据以上的研究结果，关于其功能效果的记载内容为：“胃酸过多，肠内异常发酵，排便异常（慢性痢疾、便秘）”。

　　进入21世纪，有关碱性电解水功效以及机理的研究正日见深入，就我个人的见解，功能水的研究将会在五个方面展开。一是饮用的安全性；二是饮用的口感；三是在治疗医学上的深入研究；四是在康复保健中作用；五是预防医学中的应用。特别是在预防和日常保健中的应用，无疑具有更为广泛而深远的价值。